Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lingo1Q9D1T0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lingo1Q9D1T0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lingo1Q9D1T0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms