Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl53Q9D1H8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms