Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MrnipQ9D1F5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MrnipQ9D1F5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms