Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acbd6Q9D061 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acbd6Q9D061 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Acbd6Q9D061 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms