Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc18Q9CZJ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc18Q9CZJ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms