Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snf8Q9CZ28 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms