Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp1Q9CYR0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssbp1Q9CYR0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms