Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem39aQ9CYC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem39aQ9CYC3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms