Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXJ1

Ears2, Probable glutamate--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ears2Q9CXJ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ears2Q9CXJ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ears2Q9CXJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ears2Q9CXJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ears2Q9CXJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ears2Q9CXJ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ears2Q9CXJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ears2Q9CXJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms