Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed5Q9CXE7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms