Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxxc1Q9CWW7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms