Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Sycp2Q9CUU3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Sycp2Q9CUU3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms