Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snw1Q9CSN1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snw1Q9CSN1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms