Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms