Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ska2Q9CR46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ska2Q9CR46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms