Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl28Q9CR40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl28Q9CR40 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl28Q9CR40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms