Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Polr3kQ9CQZ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms