Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PclafQ9CQX4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PclafQ9CQX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms