Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ykt6Q9CQW1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ykt6Q9CQW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ykt6Q9CQW1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 644 ms