Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.4 ms