Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med30Q9CQI9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med30Q9CQI9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med30Q9CQI9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms