Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed6Q9CQG0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms