Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc5Q9CQA1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms