Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.9 ms