Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp2Q9CQ73 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp2Q9CQ73 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pkp2Q9CQ73 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pkp2Q9CQ73 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms