Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rpa3Q9CQ71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpa3Q9CQ71 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpa3Q9CQ71 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms