Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc18Q9CQ07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms