Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Commd4Q9CQ02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Commd4Q9CQ02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms