Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npm3Q9CPP0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Npm3Q9CPP0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npm3Q9CPP0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms