Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim26Q99PN3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim26Q99PN3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim26Q99PN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms