Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scd3Q99PL7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms