Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn6Q99PL6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms