Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim8Q99PJ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim8Q99PJ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim8Q99PJ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms