Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpin3Q99PI4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpin3Q99PI4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lpin3Q99PI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpin3Q99PI4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms