Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap4Q99P47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap4Q99P47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap4Q99P47 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms