Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vgll1Q99NC0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms