Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kremen1Q99N43 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kremen1Q99N43 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kremen1Q99N43 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms