Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Brms1Q99N20 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brms1Q99N20 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms