Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr3Q99MB1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr3Q99MB1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tlr3Q99MB1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr3Q99MB1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms