Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gins4Q99LZ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gins4Q99LZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms