Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Abcf2Q99LE6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Abcf2Q99LE6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms