Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim11aQ99J19 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim11aQ99J19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim11aQ99J19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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