Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc8b1Q925Q3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc8b1Q925Q3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc8b1Q925Q3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms