Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp8Q924X6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp8Q924X6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrp8Q924X6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms