Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smc6Q924W5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc6Q924W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc6Q924W5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms