Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim59Q922Y2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim59Q922Y2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms