Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb6Q922F4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb6Q922F4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb6Q922F4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms