Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bp4Q921I6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bp4Q921I6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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