Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FdpsQ920E5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FdpsQ920E5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FdpsQ920E5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms