Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Afg3l1Q920A7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l1Q920A7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Afg3l1Q920A7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms